分子的機械作用如何影響活細胞中染色質的波動動力學的計算研究
刊登日期:2024-05-02
真核細胞的遺傳信息存儲在其染色質中，染色質是一種類似聚合物的實體，由DNA和組蛋白組成，密集地包裝 在細胞核內。細胞核還包含各種亞核區，其相對於染色質的時空協調被認為是決定基因表達的重要因素。同時，在 活體細胞中，為實現細胞功能，各種其他亞核分子如酶(如聚合酶和拓撲異構酶)應該在起作用，而這些作用分子對 染色質中亞核區的波動動態可能會產生機械干擾。由本所平岩徹也博士(曾任新加坡國立大學 Mechanobiology Institute)和Jacques Prost博士(Curie Institute，巴黎)領導的國際合作團隊數值上證明了某些類型的干擾確實增強了複 雜的聚合物介質(用以模擬染色質)中的粒子(用以模擬亞核區)的波動。他們還澄清了這種波動動態可以通過三種動態模 式的組合有效地描述，其中包括一種與聚合網格的動態重構相關的新發現模式。這一洞察提供了一個新的視角，說明 了分子的機械干擾如何通過調節亞核區聚動態來調控基因表達。完整的研究資料已發表於Physical Review Letters, Vol. 132, 058401 (2024)。
期刊連結: https://journals.aps.org/prl/abstract/10.1103/PhysRevLett.132.058401